Fundación
Sus orígenes se sitúan en 1945 en el que un grupo de estudiantes de Villa San Carlos, como se denominó anteriormente los Estudios Politécnicos Madre de Dios, actual Safa Funcadia, muestran la inquietud por fundar una cofradía. El entusiasmo y experiencia de estos jóvenes animaron a su director, el Padre Jesuita Antonio Garmendia de Otaolaurruchi a continuar el proyecto. Por lo que en 1949 se aprobaron los estatutos.
Fechas destacadas
1949. Se realiza la primera salida procesional.
1960. Se establece la parroquia de San Sebastián como nueva sede canónica.
1963. Se realiza el desfile procesional bajo una fuerte tromba de agua. Ningún nazareno abandonó su puesto.
1975. Se aprueban nuevos estatutos gracias a un grupo de hermanos que se interesan por aumentar la actividad de la hermandad.
1978. La hermandad se hace cargo de los cultos, acto y procesión del Patrón San Sebastián.
1999. Se celebra una función extraordinaria debido al 50 aniversario.
2013. Las inclemencias meteorológicas impidieron la salida procesional. Por primera vez en 64 años, la cofradía no puede realizar la estación de penitencia.
Curiosidades
Su primera salida se realizó en 1946, desde la Villa de San Carlos hasta el convento de las Hermanas de la Cruz, de ahí su estrecha vinculación. En 1984, la hermandad encabezó la iniciativa de captación de donativos para el monumento de Sor Ángela de la Cruz de la plaza Niña, realizada por León Ortega.
Sus primeras salidas se realizaban desde el Sagrado Corazón de Jesús, que era su sede canónica.
La primera idea para la advocación de la titular era Madre de Dios de los Dolores.
En un principio, la imagen de Jesús era la de un Cautivo. En 1950, se sustituye esta imagen por la de un crucificado, debido al carácter de seriedad y recogimiento que adquirió la hermandad. La imagen del cautivo fue cedida a la iglesia de Nuestra Señora de Fátima de la Arquería.
Es el único crucificado de Huelva que gira la cabeza al lado izquierdo en el momento de expirar.
Tiene una estrecha vinculación con la Universidad de Huelva, cuenta con algunas insignias dedicadas a la Onubense. Además, en la corona de la Virgen, hay un pequeño libro que representa a los estudiantes que fundaron la hermandad.
La hermandad se hizo cargo de la realización de los cultos a San Sebastián desde que se extinguiera la Hermandad del Santo Patrón a mediados del siglo XX.